Le grand missionnaire jésuite est mort le 3 décembre 1552 sur l’île chinoise de Sancian. On érigea une église sur les lieux, autour de son tombeau, où est écrit en portugais, en latin, en japonais, et en chinois : « Ici est enseveli l'homme vraiment apostolique ». Mais ce tombeau est vide ; en 1554, son corps, intact, fut transporté au collège des jésuites de Goa. Puis transféré dans l’église du Bon Jésus de Goa en 1624 (elle avait été consacrée en 1605).
L’apôtre des Indes avait été canonisé en 1622, et son corps fut mis dans un cercueil de verre inclus dans une châsse d’argent sur un mausolée de marbre de Toscane offert par Côme III de Médicis.
Le corps de saint François Xavier fut exposé chaque 3 décembre jusqu’en 1974. Depuis lors il l’est tous les dix ans. (Photo de 2004).